Лаборатория микробиологии

Внедрены новые методы исследования микробиоты, которые основаны на последних достижениях молекулярно-генетических и масс-спектрометрических технологий.

• баканализатор Vitec 2 Compact — для идентификации микроорганизмов и определения их антибиотикочувствительности:Среднее время получения результата идентификации: 5-6 часовСреднее время получения результата чувствительности к антимикробным препаратам: 12-16 часов
• анализатор бактериологический гемокультур BACTEC 9050 — Возможность диагностики сепсиса в максимально короткие сроки — 90% положительных результатов выявляются в течение первых суток. Максимальное время протокола исследования занимает 5 дней
• система MALDI Biotyper  —  революционная разработка в области микробиологии. Система за несколько секунд оценивает наличие уникального набора белков неизвестного микроорганизма. Идентификация МО с помощью MALDI Biotyper – современный, быстрый и рентабельный метод, основанный на масс-спектрометрическом анализе, позволяет проводить прямую идентификацию бактерий,  обеспечивает возможности  работы с положительными гемокультурами, ликвором и жидкими средами, содержащих достаточное количество микроорганизмов
• баканализатор Адажио (Adagio) — представляет собой систему считывания антибиотикограмм и систему анализа результатов. Считывание чашки с дисками происходит за несколько секунд. На основе полученных данных прибор рассчитывает минимальную ингибирующую концентрацию по международным критериям NCCLS (CLSI) и дает заключение о резистентности, выявляя такие фенотипы, как ESBL, MRSA, VRE и многие другие
• наборы различных тест-системы  для идентификации грибов и определения их чувствительности к антибиотикам FUNGIFAST (ELITech Microbio, Франция) — достоинства: предназначены для идентификации основных видов патогенных дрожжевых грибов человека, а также для проведения теста на резистентность к различным противогрибковым препаратам, применяемых при лечении поверхностных и системных микозов за 24-48 часа
• система Sensititre для проведения анализа  чувствительности к антимикотикам, с определением МПК противогрибковых препаратов
• питательные и транспортные среды — достоинства: использование питательных, хромогенных  и транспортных сред ведущих мировых производителей в области микробиологии позволяет проводить исследования микроорганизмов на высоком уровне
• прибор для приготовления питательных сред серии MasterClave® позволяет быстро, просто и безопасно приготовить питательную среду высокого качества. Постоянное перемешивание среды и мониторинг температуры в процессе приготовления, а также точное соблюдение условий стерилизации обеспечивают высокое качество среды
• с помощью Real-time-амплификатора Rosh LithCycler 96 разработана и внедрена новая технология выявления мобильных генетических элементов, отвечающих за формирование резистентности к карбапенемам у клинических штаммов синегнойной палочки  (P. aeruginosa)

В качестве самостоятельного подразделения НИИ педиатрии лаборатория микробиологии  появилась в 1998 г. во главе с доктором биологических наук, профессором Л.К. Катосовой. Основными научными достижениями лаборатории явились установление этиологического спектра возбудителей острых и хронических заболеваний органов дыхания у детей, а также роли атипичных возбудителей при острых и хронических инфекционно-воспалительных болезнях у детей. В последние годы в лаборатории появились новые методы исследования, основанные на достижениях молекулярно-биологических технологий. К ним относятся различные варианты определения последовательности нуклеиновых кислот инфекционных возбудителей (секвенирование, ПЦР), а также изучения их белкового спектра (масс-спектрометрия). Перспективным направлением в изучении механизмов резистентности внебольничных и госпитальных возбудителей является совершенствование технологий, разработка и внедрение новых методов молекулярной микробиологии для диагностики инфекций, выявления механизмов резистентности микроорганизмов к антибактериальным агентам и способов ее оценки.

С 2012 г. заведует лабораторией микробиологии Анна Валерьевна Лазарева — кандидат медицинских наук, член международной ассоциации клинических микробиологов и химиотерапевтов (МАКМАХ).

Лаборатория обслуживает все подразделения НМИЦ здоровья детей.

•микробиологический мониторинг и оптимизация антибактериальной терапии инфекционно-воспалительных заболеваний в многопрофильном дневном стационаре
•этиология и лечение острых заболеваний верхних и нижних дыхательных путей и ЛОР-органов у детей
•современные технологии диагностики и лечения хронической воспалительной патологии носоглотки и среднего уха у детей
•микробный пейзаж и молекулярные механизмы резистентности к антибиотикам при инфекционных осложнениях у детей с тяжелой черепно-мозговой травмой
•молекулярные механизмы резистентности бактерий к антибиотикам и микробиологическое обоснование ротации антибиотиков в отделении реанимации и интенсивной терапии

От правильности сбора биоматериала зависит адекватность полученного результата!!!

Пробы при инфекционно-воспалительных процессах нижних дыхательных  путей (мокрота) у детей старше 5 лет.

Пробы материала из нижних дыхательных путей собирают особенно тщательно,  т. к. в процессе сбора проба может быть контаминирована микроорганизмами, обсеменяющими верхние дыхательные пути.

Предпочтителен утренний сбор свободно отделяемой (отхаркиваемой) мокроты.

Перед сбором мокроты ребенок, если это возможно, должен:

1. Почистить зубы
2. Сполоснуть рот и горло теплой кипяченой водой
3. Если ребенок не в состоянии сделать это сам, то туалет его ротовой полости осуществляют родители или медицинский персонал.

Необходимо предупредить ребенка, чтобы он не собирал в контейнер слюну или носоглоточное отделяемое.

Пробу мокроты, полученную в результате глубокого кашля, собирают в специальный стерильный одноразовый контейнер с завинчивающейся крышкой и передают в лабораторию в течение 2-х часов.

Пробы при инфекционно-воспалительных процессах мочеполовой системы (моча)

Общие правила сбора проб:

1. Для анализа мочи при естественном мочеиспускании используют среднюю утреннюю порцию;
2. Не допускается собирать мочу с постельного белья, горшка, памперса;
3. Для проведения обработки не допускается использовать дезинфектанты, т.к. при попадании в пробу они могут подавлять рост микроорганизмов;

Пробу мочи передают в лабораторию не позднее 2-х часов с момента сбора; для сбора и доставки проб в лабораторию используют стерильные одноразовые контейнеры с завинчивающейся крышкой. Для микробиологического исследования не допускается использовать пробу из суточной мочи.

Правила сбора мочи у новорожденных и маленьких детей при естественном мочеиспускании.

1. Собирающий пробу, должен вымыть руки с мылом, сполоснуть водой, высушить;
2. Дайте ребенку попить воды или другой жидкости, пригодной для питья;

У девочек тщательно промывают отверстие мочеиспускательного канала, промежность и область заднего прохода теплой мыльной водой или жидким мылом, затем споласкивают теплой кипяченой водой, высушивают стерильной марлевой салфеткой;

1. Усаживают ребенка на колени взрослого;
2. Наружные половые губы необходимо держать на расстоянии друг от друга в процессе мочеиспускания;
3. Собирается средняя порция мочи в специальный одноразовый контейнер с завинчивающейся крышкой;

У мальчиков 2 первых этапа подготовки выполняются так же, как  для девочек, затем:

1. Пенис и оттянутую крайнюю плоть (при ее наличии и отсутствии в ней проблем), а также область заднего прохода моют теплой мыльной водой, ополаскивают теплой кипяченой водой и высушивают стерильной марлевой салфеткой;
2. Усаживают ребенка на колени взрослого;
3. При мочеиспускании необходимо держать крайнюю плоть оттянутой для предотвращения контаминации пробы мочи микроорганизмами с кожи.

Дальнейшие этапы сбора пробы проводятся так же, как у девочек.

Пробы фекалий при подозрении кишечных инфекций (сальмонеллез, дезентерия)

1. Сбор проб фекалий осуществляют с помощью ректального тампона. Вводят кончик стерильного зонда-тампона на 2,5-3,0 см за анальный сфинктер;
2. Осторожно вращая тампон вокруг оси, собирают материал ануса и так же осторожно извлекают тампон;
3. Помещают тампон в стерильную одноразовую пробирку с транспортировочной средой;
4. Передают материал в лабораторию.

Следует иметь в виду, что ректальные мазки для получения необходимой информации — материал существенно худший по сравнению с пробой фекалий, даже в случае наличия трудности сбора материала у маленьких детей.