Консультативно диагностический центр

• Отделение амбулаторной нейроортопедии
• Отделение комплексного медицинского обслуживания
• Консультативное отделение
• Отделение вакцинопрофилактики детей с отклонениями в состоянии здоровья и семейной вакцинации
• Стоматологический кабинет

Дневной стационар

• Отделение амбулаторной хирургии
• Отделение восстановительного лечения детей с болезнями ЛОР-органов и челюстно-лицевой области
• Отделение стационарозамещающих технологий (ОСЗТ)
• Отделение неотложной педиатрии с группой анестезиологии-реанимации

Круглосуточный стационар

• Приемное отделение
• Отделение диагностики и восстановительного лечения
• Ревматологическое отделение
• Пульмонологическое отделение
• Гастроэнтерологическое отделение с гепатологической группой
• Кардиологическое отделение
• Нефрологическое отделение
• Отделение патологии новорожденных детей
• Отделение реанимации и интенсивной терапии новорожденных и детей грудного возраста
• Отделение анестезиологии-реанимации с операционным блоком и кабинетом переливания крови
• Отделение реанимации и интенсивной терапии

Отделения восстановительной медицины

• Отделение лечебной физкультуры
• Физиотерапевтическое отделение

Научные подразделения

• Отделение неотложной детской хирургии и травм детского возраста
• Лаборатория питания здорового и больного ребенка
• Лаборатория экспериментальной иммунологии и вирусологии
• Лаборатория неврологии и когнитивного здоровья