В соответствии  с Государственным заданием на 2017 г. в отчетный период сотрудниками Центра выполнялись 54 НИР по приоритетным направлениям развития науки, технологий и техники, критическим технологиям РФ.

В Научном центре здоровья детей качество медицинской помощи обеспечивается не только высоким классом специалистов, превосходным уровнем оснащенности, но и благодаря внедрению самых современных научных разработок в клиническую педиатрию. В центре впервые в педиатрической практике был внедрен персонифицированный мультидисциплинарный подход. На сегодняшний день накоплен огромный опыт проведения таргетной терапии генно-инженерными биологическими препаратами пациентов детского возраста с системными иммуноагрессивными болезнями (такими, как  ювенильный ревматоидный артрит, воспалительные заболевания кишечника, аллергические болезни).